《黑道家族 第六季》的剧情围绕着意大利移民后裔托尼·瑟普拉诺的生活展开。托尼是新泽西最大犯罪集团的头目，但他的生活远非黑手党电影中描绘的那样威风八面。他面临着来自家庭和事业的双重压力。在事业上，犯罪集团在垃圾处理厂的掩护下从事贩毒、赌场、谋杀等生意，但内部运作并不顺畅，且时刻受到联邦调查局的监视。

托尼的叔叔克拉多虽然喜欢他，但不甘心位居晚辈之后，利用托尼强悍的寡母来达到自己的目的。被托尼抚养长大的克里斯托弗对他忠心耿耿，但年轻的他生性冲动，经常给黑帮引来麻烦。

在家庭方面，托尼与顺从的妻子、叛逆的儿子、学业出众的女儿之间的关系也颇为复杂。此外，他还有个众人皆知的情妇和一个听他倾诉的心理医生。

本季剧情中，托尼不仅要应对黑帮内部的纷争和外部的威胁，还要处理家庭中的种种矛盾。他在事业和家庭的双重压力下，生活得异常艰难，甚至一度陷入危险之中。