《超人前传第五季》以超人克拉克·肯特在斯莫维尔小镇的成长故事为主线。这一季中，克拉克手中的三种元素石终于集齐，它们汇集成一颗耀眼的水晶体，指引他前往北极。在那里，水晶体深入冰层，引发了一场惊人的地质变动，最终形成了一座由水晶锥体构成的冰宫，成为克拉克的新居所。

同时，小镇上出现了两位拥有超能力的陌生人，他们身上有着氪星文字的纹身，这为克拉克和他的朋友们带来了新的挑战。另一方面，朗娜因使用元素石自卫而引发的一系列事件仍在发酵，她逃亡中的遭遇也愈发扑朔迷离。而克拉克则在一次神秘的消失后，竟然出现在了南极的腹地，这让他的朋友们开始怀疑他的真实身份。

本季中，克拉克和他的亲朋好友们将面临更多未知的考验和挑战，他们必须携手合作，才能揭开隐藏在背后的真相。