《巴格达总局》以2003年萨达姆政权倒台后的伊拉克为背景，深入描绘了那个动荡时期的混乱与挣扎。剧情中，伊拉克前警察Muhsin al-Khafaji在战乱中失去了家园、妻子和事业，同时还得保护自己和生病的女儿免受伤害。姐夫的绝望请求让他不得不涉足寻找失踪侄女的危险之旅。

然而，Khafaji在侄女的大学或她原计划的翻译工作所在的绿区询问时，却遭遇了冷漠与排斥。随着调查的深入，Khafaji逐渐发现这并非一起简单的失踪案，而是牵涉到政府腐败、恐怖分子和利益集团之间的复杂阴谋。在这场危机四伏的旅程中，Khafaji不仅要面对外界的重重困境，更要面对内心的挣扎与选择，为了家人，他必须勇敢地揭露真相，守护自己所爱之人。