《机兽起源》是一部发生在2005年的日本动漫，背景设定在一个经历神祇愤怒引发的大规模地轴变动后的星球Zi。这场灾难导致曾经繁荣的高度文明走向毁灭，数千年后，幸存的人类在这片废墟上建立起自己的文明。

在这个世界中，机兽（ゾイド）是不可或缺的存在，它们是人类文明的象征，也是战斗和劳动的重要工具。机兽的供应依赖于从地下和海中发掘的遗迹。因此，以发掘机兽为生的族群应运而生。

故事的主人公鲁吉·法米隆就生活在这样的环境中，他是米洛德村的一员，平时帮助家族从事机兽发掘工作。某日，他在挖掘一艘近海沉没的蓝色机兽时，目击了一个从未见过的银色机兽袭击村庄。鲁吉迅速驾驶蓝色机兽“姆拉萨梅莱格尔”迎战，成功击退了银色机兽。然而，这场战斗导致村庄的能源发生器损坏，鲁吉因此踏上了寻找能够修复能源发生器的匠人的旅程。