《隐世小神瞳》的剧情设定在一个神秘而古老的村落，这里的居民都拥有一种被称为“神瞳”的奇特能力。故事的主角是一个看似痴傻的小伙，他在一次偶然的机会下，意外获得了一位传奇神医的传承，从此他的命运发生了翻天覆地的变化。

随着剧情的推进，小伙逐渐展现出惊人的医术和神瞳的力量，他能够透视人体，发现疾病的根源，并用独特的方法治愈各种疑难杂症。他的名声逐渐传遍了整个村落，甚至吸引了来自远方的求医者。

然而，随着他神瞳能力的不断显现，也引来了各种贪婪和恶势力的觊觎。小伙必须面对种种挑战和考验，不仅要保护自己和家人，还要坚守自己的信念和医德，用神瞳的力量去帮助更多的人。

整个剧情充满了神秘、惊险和感人的元素，展现了人性中的善良与贪婪、勇敢与懦弱，以及对于信仰和正义的坚持与追求。