《美女秘书被调包》的剧情设定在一个繁忙的都市背景下。故事的主角是一位名叫林悦的美女秘书，她聪明能干，深受公司高层的器重。然而，一天晚上，林悦在回家的路上被不明身份的人绑架，醒来时发现自己被调包成了一个与她外貌相似的神秘女子。

林悦惊恐地发现，这个神秘女子与她有着截然不同的身份和生活背景。为了找回自己的身份，林悦开始深入调查，发现这一切背后隐藏着一个巨大的阴谋。在这个过程中，林悦不仅要面对来自绑匪的威胁，还要应对公司内部的复杂人际关系和暗流涌动的商业斗争。

经过一番波折和努力，林悦最终揭露了真相，找回了自己的身份，并成功地将绑匪绳之以法。这个故事充满了悬念和转折，展现了主人公林悦的坚韧和智慧，以及她面对困境时的不屈不挠。