《念念无安短剧》的剧情紧凑且充满反转。故事发生在古代的花陵城，司小念是一位风姿绰约、经营成衣铺的老板娘，而晏无明则是表面温润如玉的书生，实则是朝廷暗卫营今嵬司的指挥使。两人因机缘巧合相遇并迅速坠入爱河，尽管各自隐瞒着真实身份，他们还是决定结为夫妻。

婚后，司小念和晏无明继续以双重身份生活，一面是恩爱夫妻，另一面则是江湖顶级女杀手与朝廷暗卫。然而，敌国质子即将归城，两人同时接到任务，一个要刺杀质子，另一个则需暗中保护质子平安进城。随着任务的深入，他们发现彼此的任务竟然相互冲突，而对手似乎就是自己的枕边人。

在经历了一系列惊心动魄的暗斗后，两人终于识破了对方的身份，但深厚的感情让他们选择继续携手，共同面对即将到来的危机。最终，他们联手化解了危机，揭露了背后的阴谋，并选择归隐山林，过上了平静而幸福的生活。