《星际迷航：下层舰员 第五季》的剧情延续了该系列一贯的幽默与科幻风格。故事聚焦于星际舰队中一艘不太受重视的舰船——U.S.S. Cerritos号上的下层舰员们。这一季中，船员们继续在日常工作中遭遇各种离奇事件，他们不仅要应对太空探险中的未知危险，还要处理舰船内部的各种矛盾和笑料百出的日常。

随着剧情的推进，船员们陷入了一系列高尚、低俗但充满真心的胡闹中。他们不仅要面对外星生物的威胁，还要解决舰船内部的技术故障和人际冲突。同时，一些老角色之间的恩怨情仇也在这一季中得到了进一步的展现和化解。

在这一季的某个亮点剧情中，船员们意外卷入了一场涉及星际政治和道德抉择的复杂事件中，他们必须团结一致，才能化解危机，保护舰船和船员的安全。整体而言，这一季的剧情充满了惊喜和转折，让观众在欢笑中感受到了《星际迷航》系列的魅力。