《危机边缘 第二季》剧情紧接第一季，继续深入探索科学与超自然现象的交织。一季开篇，国际航班神秘坠毁，所有乘客和机组人员离奇死亡，FBI女特工奥莉维亚奉命调查，意外卷入一个名为“Fringe”的秘密部门。她与天才科学家沃尔特·毕舍普及其子彼得合作，面对一系列超乎想象的超自然案件。

在这一季中，他们遇到了被意念控制的警察、拥有控制他人思想的神秘力量、以及古老的泰迪熊所发出的神秘声音等种种奇异现象。每个案件都充满了惊悚与悬疑，挑战着他们的智慧和勇气。同时，他们也逐渐揭露了隐藏在“Fringe”背后的秘密，以及彼得过去的阴影。随着剧情的深入，他们不仅要面对外在的威胁，还要面对内心的挣扎和选择。