《我家来了个怪男人》剧情紧凑且充满奇幻色彩。

患有男性恐惧症的宅腐女费菲，意外地与一个名为海洋的中二妖孽男开始了“同居”生活。两人性格迥异，矛盾频发，生活因此变得鸡飞狗跳。费菲的梦想是出版图书成为畅销书作家，然而这一路上并不顺利，她屡屡受挫。同时，海洋的中二病也让他在Cosplay大赛中遇到了不少挫折。

在最艰难的时刻，这两个原本吵闹不断的人却成为了彼此最坚实的依靠，相互鼓励，共同走出了困境。在朝夕相处中，费菲渐渐发现了海洋的奇怪之处，并发现他是从自己的一本未完结小说《男神修炼手册》中穿越而来的男三号，他穿越的目的是为了改写自己的命运。

尽管两人都对彼此产生了情愫，但出于种种原因，他们都没有勇气将这份爱意说出口。而另一边，周璟顼和沐晨的出现，更是让费菲陷入了前所未有的危机之中。海洋为了救费菲，不惜一次次用掉自己的穿越机会，甚至不惜交付自己的生命。