《小丑2：双重妄想》的剧情承接前作，故事发生在“小丑”亚瑟·弗莱克被捕之后。他在狱中等待着审判日的到来，期间与自己的双重人格进行着激烈的缠斗。在这段痛苦而漫长的日子里，亚瑟意外地邂逅了真爱，同时，他内心深处潜藏的旋律也被逐渐释放。

影片的主要场景在监狱与法庭之间来回穿插，通过动画短片回顾了前作的剧情，为观众铺设了必要的背景信息。亚瑟在狱中继续经历着精神上的折磨，但他的世界却因这段禁忌之恋而出现了微妙的变化。心理医生哈莉·奎茵在治疗过程中，对患有严重精神分裂症的亚瑟产生了深深的情感牵绊，为这混沌的世界带来了一丝温暖与救赎的微光。然而，这段关系也在爱与病态、理智与疯狂的边界线上翩翩起舞，构成了影片核心的戏剧冲突与情感张力。

随着剧情的深入，亚瑟的世界变得更加阴暗与绝望，影片通过一系列事件探讨了人性的复杂性与社会的边缘议题。