《高达创形者 再起 第二季》的剧情承接前作，时间设定在传说中的部队——创形者队拯救EL潜行者后的两年。此时，曾经的战场高达模型联网对战（GBN）已经升级，加入了感觉反馈功能，使得玩家的代入感得到进一步提升。在这个世界里，许多潜行者并非盲目跟风，而是怀揣着各自的想法进入GBN。

悠人是一位扮演着佣兵的潜行者，他独自徘徊于次元世界空间。风见则孤傲轻佻，梦想受到众人崇拜，经常穿梭于不同的团队之间。芽依是个高达模型对战狂热者，从早到晚都在进行对战，浑身散发着神秘气息。而孤独的新人帕维兹对合作玩法深感兴趣，却因内向的性格未能如愿。

这些原本孤独的玩家，因为某个契机组成了新的“创形者”队伍。他们面对的，是超越GBN的无极限超体验。在这个充满挑战与机遇的世界里，他们不断成长，共同面对各种困难，最终实现了自我超越，也为观众带来了精彩的视觉盛宴。